Jeśli w trakcie histeroskopii diagnostycznej lekarz zauważy jakąś nieprawidłowość, może ją natychmiast usunąć i przekazać do analizy histopatologicznej. Na wycięcie zmian, takich jak mięśniaki podśluzówkowe, polipy endometrialne, polipy szyjki macicy, zrosty wewnątrzmaciczne czy wrodzone wady macicy np. obecną przegrodę, pozwalają dołączone do  histeroskopu mikronarzędzia chirurgiczne.

Histeroskopię przeprowadza się określonym momencie cyklu, tj. tuż po miesiączce, a przed owulacją, kiedy błona śluzowa macicy jest jeszcze dostatecznie cienka. Zabieg trwa od kilku do kilkunastu minut, a ponieważ wykonuje się go w krótkim znieczuleniu dożylnym, jest bezbolesny. Z tego jednak powodu pacjentka do zabiegu musi zgłosić się na czczo.

Przez kilka dni po zabiegu może utrzymywać się lekkie krwawienie z dróg rodnych oraz bóle podbrzusza. W tym czasie kobieta powinna odpoczywać, unikać wysiłku fizycznego i dźwigania ciężkich przedmiotów. W niektórych przypadkach lekarz może przepisać antybiotyk w celu uniknięcia infekcji. Histeroskopia jest zabiegiem bezpiecznym, a powikłania zdarzają się niezwykle rzadko. Jeśli jednak pomimo upływu czasu objawy nasilają się zamiast ustępować lub pojawi się gorączka, kobieta powinna niezwłocznie skonsultować się z lekarzem.